SARS-CoV-2: la gravedad de la variante B.1.1.529, ahora llamada Omicron

La variante B.1.1.529 se notificó por primera vez a la OMS desde Sudáfrica el 24^th Noviembre de 2021. La primera infección confirmada conocida por B.1.1.529 fue de una muestra recolectada el 9^th Noviembre de 2021¹. Otra fuente² indica que esta variante se detectó por primera vez en muestras recogidas en 11^th Noviembre de 2021 en Botswana y el 14^th Noviembre de 2021 en Sudáfrica. Desde entonces, el número de casos de COVID-19 ha aumentado considerablemente en casi todas las provincias de Sudáfrica. Como en 27^th Noviembre de 2021, también se han reportado nuevos casos de esta variante en Bélgica, Hong Kong, Israel, Reino Unido.³, Alemania, Italia y la República Checa, que tienen un origen relacionado con los viajes.  

Gracias a las autoridades sudafricanas por no tomarse el tiempo de comunicar y compartir información relevante con la comunidad científica mundial para que el grupo de expertos de la OMS pudiera reunirse el 26^th Noviembre de 2021 y designe rápidamente esta variante como Variante de preocupación (VOC). La gravedad del asunto podría medirse por el hecho de que B.1.1.529 fue designada como una variante en seguimiento (VUM) hace solo dos días el 24^th Noviembre de 2021 antes de ser designado como COV el 26^th Noviembre de 2021 sin haber sido designado primero como variante bajo investigación (VOI).  

Tabla: Variantes preocupantes (COV) del SARS-CoV-2 al 26 de noviembre de 2021 

La urgencia de designar B.1.1.529 como una variante de preocupación (VOC) se justificó porque se encontró que esta variante es la variante más divergente de SARS-CoV-2 hasta el momento. En comparación con el virus SARS-CoV-2 detectado originalmente en Wuhan, China, este tiene hasta 30 cambios de aminoácidos, 3 pequeñas deleciones y 1 pequeña inserción en la proteína de pico. De estos cambios, 15 se encuentran en el dominio de unión al receptor (RBD), la parte del virus que le permite ingresar a las células humanas, lo que lleva a la infección. Esta variante también tiene una serie de cambios y deleciones en otras regiones genómicas.². Las mutaciones son tan extensas que se podría llamar una nueva cepa, en lugar de una variante. La cantidad increíblemente alta de mutaciones de picos significa una mayor posibilidad de escape de anticuerpos conocidos que hacen que esta variante sea motivo de gran preocupación.⁵.  

El cambio a nuevas variantes es común en los coronavirus. Siempre ha sido natural que los coronavirus sufran mutaciones en sus genomas a tasas extremadamente altas, debido a la falta de actividad nucleasa correctora de sus polimerasas; a mayor transmisión, más errores de replicación y, por tanto, más mutaciones se acumulan en el genoma, dando lugar a nuevas variantes. Los coronavirus humanos han ido acumulando mutaciones para crear nuevas variantes en la historia reciente. Hubo varias variantes responsables de las epidemias desde 1966, cuando se registró el primer episodio⁶. Pero, ¿por qué una mutación tan extensa en un solo estallido? Puede ser porque la variante B.1.1.529 evolucionó durante una infección crónica de una persona inmunodeprimida, posiblemente un paciente con VIH / SIDA no tratado.⁷.  

Cualquiera que sea la causa de mutaciones extensas, si la rápida velocidad a la que se ha propagado en Sudáfrica es una indicación, la evolución de esta variante puede tener una enorme influencia en la inmunidad, la transmisibilidad y la virulencia y la eficacia de las vacunas existentes, actualmente en uso.  

Si las vacunas existentes seguirán siendo efectivas contra esta nueva variante o si habrá más casos de infecciones por avance de la vacuna, actualmente hay pocos datos disponibles para sacar alguna conclusión. Sin embargo, en un estudio reciente, una variante sintética con 20 mutaciones en la proteína de pico había mostrado un escape casi completo de los anticuerpos.⁷. Esto indica que la nueva variante B.1.1.529 con muchas más mutaciones aumentadas, puede mostrar una neutralización significativamente reducida por los anticuerpos. Sin embargo, la nueva variante parece ser más transmisible debido a la rápida tasa a la que ha reemplazado a la variante Delta en Sudáfrica, aunque los datos actuales no son lo suficientemente adecuados para hacer una estimación confiable. Del mismo modo, no es posible comentar sobre la gravedad de los síntomas en esta etapa.  

En vista del hecho de que Europa ya se está tambaleando con un número inusualmente alto de casos de COVID 19 (debido a la variante delta altamente transmisible) durante las últimas semanas y el rápido ritmo al que Micron (B.1.1.529) La variante se ha extendido en Sudáfrica reemplazando recientemente a la variante delta, varios países de Europa, incluidos el Reino Unido, Alemania e Italia, han impuesto restricciones de viaje a las llegadas desde Sudáfrica y países vecinos como Botswana, Malawi, Mozambique, Zambia y Angola. Por temor a lo peor, Israel prohibirá la entrada de visitantes de todos los países.  

El mundo ha invertido mucho en desarrollar y administrar vacunas COVID-19 para proteger a las personas de la pandemia. La pregunta más importante en la mente de los científicos y las autoridades es si las principales vacunas COVID-19 como Pfizer-BioNTech, Oxford-AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson seguirán siendo eficaces contra la variante Omicron (B.1.1.529) también. . Esto se ve impulsado por el hecho de que se han informado infecciones irruptivas en Sudáfrica. Los dos casos de Hong Kong también habían recibido dosis de vacuna.⁹. 

Desarrollo de vacunas contra el "pan-coronavirus"¹⁰ (plataformas de vacunas multivalentes¹¹) parece ser la necesidad del momento. Pero, más rápidamente, puede ser posible fabricar rápidamente dosis de refuerzo de vacunas de ARNm y ADN que cubran las mutaciones. Además, el recientemente aprobado antivirales (Molnupiravir de Merck y Paxlovid de Pfizer) deberían ser útiles para proteger a las personas de hospitalizaciones y muertes.   

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Referencias:  

1. OMS 2021. Noticias - Clasificación de Omicron (B.1.1.529): Variante preocupante del SARS-CoV-2. Publicado el 26 de noviembre de 2021. Disponible en línea en https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. Consecuencias de la aparición y propagación del SARSCoV-2 B.1.1. 529 variante preocupante (Omicron), para la UE / EEE. 26 de noviembre de 2021. ECDC: Estocolmo; 2021. Disponible en línea en https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. Gobierno del Reino Unido 2021. Comunicado de prensa: Se identifican los primeros casos de la variante Omicron en el Reino Unido. Publicado el 27 de noviembre de 2021. Disponible en https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. OMS, 2021. Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2. Disponible en línea en https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: descendiente B.1.1 asociado con el sur de África con un alto número de mutaciones de Spike # 343. Disponible en línea en https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Variantes del coronavirus: lo que sabemos hasta ahora. Europeo científico. Publicado el 12 de julio de 2021. Disponible en línea en https://www.scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Trabajo con vacunas - ¿Qué sabemos sobre la nueva variante del coronavirus B.1.1.529 y deberíamos preocuparnos? Disponible en https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. y col. Alta barrera genética al escape de anticuerpos neutralizantes policlonales del SARS-CoV-2. Naturaleza (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. La variante de coronavirus fuertemente mutada pone a los científicos en alerta. Naturaleza News. Actualizado el 27 de noviembre de 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. Vacunas “pan-coronavirus”: la ARN polimerasa emerge como un objetivo de vacuna. Europeo científico. Publicado el 16 de noviembre de 2021. Disponible en https://www.scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Comunicado de prensa: el NIAID emite nuevos premios para financiar las vacunas contra el “pan-coronavirus”. Publicado el 28 de septiembre de 2021. Disponible en https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

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